Das Collegium Musicum (gegründet 2001) ist ein Berufsorchester, das sich aus freischaffenden Musikern sowie aus Mitgliedern des Orchesters der Oper Zürich zusammensetzt. Es musiziert regelmäßig mit dem Gregorius-Chor oder dessen Vokalensemble anlässlich festlicher Gottesdienste und in den Veranstaltungen der Konzertreihe Geistliche Abendmusik.

Das Orchester spielt auf "modernen" Instrumenten (mit Ausnahme der Trompeten und Posaunen in entsprechenden Werken), setzt sich aber unter der Leitung von Stephan Klarer intensiv mit historisch orientierter Aufführungspraxis auseinander.

Von seiner Gründung an arbeitete das Orchester mit dem damaligen ersten Konzertmeister des Opernhauses Zürich, mit dem Geiger Frank Gassmann zusammen. Seit dessen unerwartetem Tod 2004 ist der australische Geiger Jonathan Allen - ebenfalls Mitglied des Orchesters der Oper Zürich - ständiger Konzertmeister des Collegium Musicum.